Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SSH2Q76I76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SSH2Q76I76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SSH2Q76I76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SSH2Q76I76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SSH2Q76I76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SSH2Q76I76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms