Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDZRN4Q6ZMN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDZRN4Q6ZMN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZRN4Q6ZMN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms