Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASC2Q6XLA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CASC2Q6XLA1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CASC2Q6XLA1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CASC2Q6XLA1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CASC2Q6XLA1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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