Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VHLLQ6RSH7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VHLLQ6RSH7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VHLLQ6RSH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLLQ6RSH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms