Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF549Q6P9A3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF549Q6P9A3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF549Q6P9A3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF549Q6P9A3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF549Q6P9A3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms