Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf33Q6P1S2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf33Q6P1S2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf33Q6P1S2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf33Q6P1S2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms