Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LETMD1Q6P1Q0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LETMD1Q6P1Q0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LETMD1Q6P1Q0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LETMD1Q6P1Q0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms