Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHLDB3Q6NSJ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHLDB3Q6NSJ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHLDB3Q6NSJ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms