Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LAMTOR1Q6IAA8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMTOR1Q6IAA8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMTOR1Q6IAA8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMTOR1Q6IAA8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMTOR1Q6IAA8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms