Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MLIPQ5VWP3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MLIPQ5VWP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLIPQ5VWP3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLIPQ5VWP3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms