Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDSS1Q5T2R2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS1Q5T2R2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS1Q5T2R2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS1Q5T2R2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 584.1 ms