Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA46Q5T0L3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA46Q5T0L3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA46Q5T0L3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA46Q5T0L3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA46Q5T0L3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms