Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q5PR19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q5PR19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q5PR19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q5PR19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q5PR19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q5PR19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q5PR19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q5PR19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q5PR19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q5PR19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q5PR19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q5PR19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q5PR19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q5PR19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q5PR19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q5PR19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q5PR19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q5PR19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q5PR19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q5PR19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q5PR19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q5PR19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q5PR19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q5PR19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q5PR19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q5PR19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q5PR19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q5PR19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q5PR19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q5PR19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q5PR19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q5PR19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q5PR19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q5PR19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q5PR19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q5PR19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q5PR19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q5PR19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q5PR19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q5PR19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q5PR19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q5PR19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q5PR19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q5PR19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q5PR19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q5PR19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q5PR19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q5PR19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q5PR19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q5PR19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q5PR19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q5PR19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q5PR19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q5PR19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q5PR19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q5PR19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q5PR19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q5PR19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q5PR19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q5PR19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q5PR19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q5PR19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q5PR19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q5PR19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q5PR19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q5PR19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q5PR19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q5PR19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q5PR19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q5PR19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q5PR19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q5PR19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q5PR19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q5PR19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms