Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL39P5Q59GN2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL39P5Q59GN2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL39P5Q59GN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms