Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESCO2Q56NI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ESCO2Q56NI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESCO2Q56NI9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESCO2Q56NI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms