Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC93Q567U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC93Q567U6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC93Q567U6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC93Q567U6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC93Q567U6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms