Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP13A4Q4VNC1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP13A4Q4VNC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP13A4Q4VNC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A4Q4VNC1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms