Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROX2Q3B8N5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROX2Q3B8N5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROX2Q3B8N5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms