Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C18orf21Q32NC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C18orf21Q32NC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C18orf21Q32NC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C18orf21Q32NC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C18orf21Q32NC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms