Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTC1Q2NKJ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTC1Q2NKJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTC1Q2NKJ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTC1Q2NKJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms