Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCBQ16585 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCBQ16585 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCBQ16585 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGCBQ16585 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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