Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC2Q16515 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC2Q16515 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC2Q16515 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ASIC2Q16515 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC2Q16515 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ASIC2Q16515 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC2Q16515 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ASIC2Q16515 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ASIC2Q16515 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC2Q16515 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC2Q16515 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC2Q16515 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ASIC2Q16515 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC2Q16515 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ASIC2Q16515 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ASIC2Q16515 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ASIC2Q16515 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ASIC2Q16515 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms