Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTB1Q13884 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNTB1Q13884 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNTB1Q13884 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNTB1Q13884 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms