Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL1Q13616 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL1Q13616 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL1Q13616 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL1Q13616 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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