Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms