Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA5AQ13591 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SEMA5AQ13591 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA5AQ13591 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA5AQ13591 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA5AQ13591 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA5AQ13591 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA5AQ13591 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms