Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms