Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA3FQ13275 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA3FQ13275 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SEMA3FQ13275 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA3FQ13275 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA3FQ13275 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
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