Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP1Q12981 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BNIP1Q12981 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BNIP1Q12981 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BNIP1Q12981 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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