Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TP53BP1Q12888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TP53BP1Q12888 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TP53BP1Q12888 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TP53BP1Q12888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TP53BP1Q12888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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