Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH17Q12864 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH17Q12864 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH17Q12864 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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