Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SLFN5Q08AF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SLFN5Q08AF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLFN5Q08AF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SLFN5Q08AF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms