Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDH1Q08174 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH1Q08174 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH1Q08174 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH1Q08174 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms