Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN1BQ07699 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCN1BQ07699 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN1BQ07699 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN1BQ07699 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN1BQ07699 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms