Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD51Q06609 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD51Q06609 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD51Q06609 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD51Q06609 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms