Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RELQ04864 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RELQ04864 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RELQ04864 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RELQ04864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RELQ04864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RELQ04864 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELQ04864 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms