Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACVR1Q04771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ACVR1Q04771 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACVR1Q04771 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACVR1Q04771 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACVR1Q04771 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms