Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNB1Q02641 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CACNB1Q02641 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNB1Q02641 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB1Q02641 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB1Q02641 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms