Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FGD1P98174 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
FGD1P98174 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGD1P98174 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGD1P98174 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGD1P98174 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FGD1P98174 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGD1P98174 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGD1P98174 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGD1P98174 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGD1P98174 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FGD1P98174 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGD1P98174 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGD1P98174 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGD1P98174 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGD1P98174 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FGD1P98174 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGD1P98174 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGD1P98174 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGD1P98174 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FGD1P98174 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FGD1P98174 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FGD1P98174 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FGD1P98174 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FGD1P98174 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FGD1P98174 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGD1P98174 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGD1P98174 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGD1P98174 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FGD1P98174 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FGD1P98174 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGD1P98174 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGD1P98174 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGD1P98174 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FGD1P98174 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FGD1P98174 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGD1P98174 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FGD1P98174 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FGD1P98174 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FGD1P98174 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGD1P98174 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGD1P98174 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGD1P98174 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FGD1P98174 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGD1P98174 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGD1P98174 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGD1P98174 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGD1P98174 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FGD1P98174 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
FGD1P98174 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FGD1P98174 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FGD1P98174 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FGD1P98174 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FGD1P98174 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
FGD1P98174 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGD1P98174 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FGD1P98174 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGD1P98174 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGD1P98174 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGD1P98174 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FGD1P98174 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FGD1P98174 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FGD1P98174 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FGD1P98174 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGD1P98174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGD1P98174 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FGD1P98174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGD1P98174 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGD1P98174 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FGD1P98174 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FGD1P98174 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FGD1P98174 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FGD1P98174 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms