Protein–RNA interactions for Protein: P98077

SHC2, SHC-transforming protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC2P98077 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHC2P98077 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHC2P98077 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHC2P98077 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHC2P98077 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SHC2P98077 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SHC2P98077 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHC2P98077 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHC2P98077 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHC2P98077 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHC2P98077 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHC2P98077 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHC2P98077 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHC2P98077 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHC2P98077 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHC2P98077 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHC2P98077 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHC2P98077 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHC2P98077 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC2P98077 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC2P98077 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC2P98077 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC2P98077 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC2P98077 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC2P98077 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC2P98077 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC2P98077 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC2P98077 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC2P98077 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC2P98077 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC2P98077 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC2P98077 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC2P98077 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC2P98077 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC2P98077 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC2P98077 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC2P98077 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHC2P98077 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC2P98077 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC2P98077 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC2P98077 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC2P98077 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC2P98077 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC2P98077 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC2P98077 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC2P98077 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC2P98077 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC2P98077 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC2P98077 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC2P98077 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC2P98077 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC2P98077 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC2P98077 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC2P98077 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC2P98077 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHC2P98077 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHC2P98077 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHC2P98077 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHC2P98077 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHC2P98077 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHC2P98077 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHC2P98077 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHC2P98077 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHC2P98077 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHC2P98077 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHC2P98077 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHC2P98077 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHC2P98077 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHC2P98077 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHC2P98077 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHC2P98077 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms