Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYP4F2P78329 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP4F2P78329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP4F2P78329 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4F2P78329 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms