Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUCLG1P53597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUCLG1P53597 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUCLG1P53597 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUCLG1P53597 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms