Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNTC1P50748 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNTC1P50748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KNTC1P50748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNTC1P50748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNTC1P50748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNTC1P50748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms