Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2C2P49116 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2C2P49116 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2C2P49116 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR2C2P49116 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR2C2P49116 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.9 ms