Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARCKSL1P49006 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
MARCKSL1P49006 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCKSL1P49006 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCKSL1P49006 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms