Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TM4SF4P48230 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TM4SF4P48230 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TM4SF4P48230 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TM4SF4P48230 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TM4SF4P48230 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms