Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFRP42898 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFRP42898 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTHFRP42898 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFRP42898 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms