Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRCPP42785 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRCPP42785 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRCPP42785 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRCPP42785 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRCPP42785 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRCPP42785 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRCPP42785 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRCPP42785 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRCPP42785 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRCPP42785 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRCPP42785 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRCPP42785 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRCPP42785 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRCPP42785 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRCPP42785 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRCPP42785 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRCPP42785 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRCPP42785 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRCPP42785 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRCPP42785 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRCPP42785 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRCPP42785 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRCPP42785 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRCPP42785 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRCPP42785 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRCPP42785 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRCPP42785 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRCPP42785 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRCPP42785 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRCPP42785 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRCPP42785 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRCPP42785 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRCPP42785 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRCPP42785 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRCPP42785 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRCPP42785 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRCPP42785 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRCPP42785 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRCPP42785 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRCPP42785 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRCPP42785 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRCPP42785 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRCPP42785 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRCPP42785 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRCPP42785 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRCPP42785 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRCPP42785 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRCPP42785 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRCPP42785 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRCPP42785 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRCPP42785 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRCPP42785 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRCPP42785 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRCPP42785 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRCPP42785 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRCPP42785 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRCPP42785 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRCPP42785 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRCPP42785 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRCPP42785 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRCPP42785 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRCPP42785 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRCPP42785 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRCPP42785 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRCPP42785 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRCPP42785 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRCPP42785 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRCPP42785 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRCPP42785 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms