Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CBP42338 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CBP42338 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3CBP42338 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3CBP42338 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3CBP42338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms