Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN7P35236 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPN7P35236 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN7P35236 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN7P35236 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN7P35236 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms